同的-R集团賦予氨基酸不同

的性质如含有非极性R基的

疏水性，含极性R基的氨基酸呈亲水性蛋白质序列和氨基酸序列列构成蛋白质一级结构，然后非极性氨基酸在疏水作用下相互靠近被包埋在蛋白质内部，而亲水氨基酸则分布在蛋白质表面构成蛋白质的立体结构。此外通过氢鍵，离子键二硫键等力的作用可以使一级结构上相聚较远的氨基酸相互靠近作用，在三维空间相互联系所以当一级结构确定以后，每個氨基酸的位置和性质就决定了它与周围其他氨基酸的作用即决定了蛋白质的空间结构

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